РНК-визуализация агрессивных опухолевых клеток

Метастазы рака часто являются результатом того, что некоторые клетки ведут себя более агрессивно, чем другие клетки опухоли. Miao-Ping Chien из Erasmus MC и Daan Brinks из TU Delft совместно из двух университетов работают над методом обнаружения агрессивных клеток. Вместе со своей командой они разработали программное обеспечение и интеллектуальный микроскоп для определения последовательности РНК соответствующих клеток. В результате в будущем могут появиться новые лекарства от рака.

То два исследователя Вам нужен микроскоп, который может отображать очень большое количество клеток одновременно. Также была специальная программа для анализа изображений. Они и их команда разработали микроскоп, который непрерывно изучает изображения и идентифицирует клетки, которые проявляют аномальное поведение. Это агрессивное поведение раковых клеток происходит во временном диапазоне от минут до часов, но анализ необходимо проводить намного быстрее.

«В конце концов, вы ведь не хотите, чтобы найденные клетки снова двигались», — объясняет Бринкс. Затем микроскоп направляет луч света на присутствующие агрессивные раковые клетки. Он светится, потому что ткань была предварительно обработана специальной тканью. Затем идентифицируют светящиеся клетки, которые готовы для секвенирования и анализа РНК. Исследователям нужно от нескольких до нескольких сотен клеток».

Вероятность метастазирования

К сожалению, риск метастазирования все еще существует, даже после того, как опухоль уменьшилась благодаря лечению. Этот метастаз обычно вызывается небольшой группой агрессивных клеток, и это именно те клетки, которые ищут исследователи. Обнаружение нескольких клеток, которые по-разному ведут себя в опухоли, в течение многих лет было серьезной проблемой в исследованиях рака. Особенно необходимо получить изображение ДНК и РНК этих конкретных клеток. Снаружи клетки обнаруживаются так называемые жизненные признаки, но в агрессивных клетках они весьма изменчивы. Определение генетического профиля клеток было возможно в течение некоторого времени, но это стало возможным только в течение нескольких лет для отдельных клеток.

Поиск РНК агрессивных клеток

Работая над сложным процессом в двух лабораториях, теперь можно последовательно находить, освещать и отделять агрессивные раковые клетки от других клеток, а также определять последовательность их РНК. Исследование, о котором идет речь, было недавно опубликовано в Природа биомедицинской инженерии† Клетки обнаруживаются при биопсии, кусочке раковой ткани. Шейн. Как только вы узнаете, что происходит в этих клетках, вы сможете разработать для них лекарства. На самом деле мы открыли механизм за несколько месяцев, тогда как другим с современными технологиями потребовалось несколько лет. Мы поняли это примерно в то же время. Может быть, это станет возможным с нашим методом через несколько недель».

Подробнее о раке и ДНК

Общее количество доступных противораковых препаратов постоянно увеличивается. Это делает прогнозирование и выбор наиболее эффективных средств все более сложной задачей. Важным фактором при этом является картирование изменений ДНК в каждой опухоли. Лучшая техника для этого Полногеномное секвенирование (ВГС). Исследователи в исследовании WIDE спорят о применении этого метода для диагностики.