Обнаружение патогенных вирусов от неправильно понятых инфекций с помощью метагеномики

Медицинские факты от редакции / Джанин Баддинг 16 мая 2023 г., 23:35

В клетках нашего тела находится не только наш генетический материал, но и проникшие вирусы. Анализируя этот полный метагеном, можно определить причину вируса. LUMC – первая в Нидерландах лаборатория, которая выполняет такие сложные анализы в контексте ухода за пациентами. Эллен Карбо развила эту технику дальше. Она получит докторскую степень по этой теме 17 мая.

Эллен Карбо и Гути де Врис

У пациентов с серьезной инфекцией важно определить виновника, чтобы иметь возможность начать соответствующее лечение. Больницы используют стандартные тесты, чтобы определить, является ли это бактериальной или вирусной инфекцией. Но часто бывает так, что его так и не находят. Ютте де Врис из LUMC в сотрудничестве с медицинскими микробиологами и учеными-биоинформатиками разработала метод одновременного обнаружения всех потенциальных вирусов, включая новые вирусы. Она клинический вирусолог кафедры медицинской микробиологии и доцент Центра инфекционных заболеваний Лейденского университета (LU-CID). Вместе с кандидатом наук и молекулярным биологом/биоинформатиком Эллен Карбо она усовершенствовала этот метод и сделала его пригодным для диагностики пациентов.

Программное обеспечение для обнаружения вирусов

Де Врис и Карбо используют метагеномы пациентов, извлеченные, например, из крови или спинномозговой жидкости, в зависимости от клинической картины. Таким образом, этот метагеном состоит не только из генетического материала больного, но и из бактерий и вирусов, которые кто-то несет с собой. Карбо: «Если вы начнете секвенировать весь метагеном, где мы идентифицируем нуклеотидную последовательность ДНК, вы также сможете получить всю информацию о вирусах. Мы используем существующее программное обеспечение для обнаружения вирусов. Это озадачивает фрагменты ДНК из образца пациента и указывает, к какому типу вируса он принадлежит из базы данных всех вирусов человека и животных. При более высокой концентрации вы знаете, что вирус в этот момент усиленно размножается и, таким образом, может быть причиной заражения. Де Врис подчеркивает, что эта технология была усовершенствована и стала более чувствительной. Вы же не хотите иметь ложноотрицательные и ложноположительные результаты. Теперь тест обеспечивает уровень достоверности от 90 до 95 процентов.

Образцы из дома и за рубежом

Больницы теперь знают, где найти лабораторию LUMC Experience Lab. Образцы пациентов из Нидерландов и из-за рубежа регулярно приезжают в Лейден для проверки метагенома и идентификации вируса в случае неправильного понимания инфекции. Де Врис говорит, что тест теперь используется только в таких случаях. Этот метод все еще слишком дорог для применения на ранней стадии диагностики. Но если это станет дешевле и тест будет развиваться дальше — мы делаем это совместно с сетью секвенирования в рамках Европейского общества клинической вирусологии, движущей силой которой является LUMC — я могу представить, что в будущем это станет более доступным. Иногда стандартные тесты требуют, чтобы пациенты прошли много тестов, и возбудитель так и не был обнаружен. Наш тест дает окончательный ответ, в том числе о новых вирусах.

Источник: ЛУМК

Медицинские факты от редакции / Джанин Баддинг

Я специализируюсь на интерактивных новостях для поставщиков медицинских услуг, поэтому каждый день медицинские работники информируются о новостях, которые могут иметь к ним отношение. Оба разработали новости и новости специально для поставщиков медицинских услуг и лиц, назначающих рецепты. Социальные сети, женское здоровье, защита интересов пациентов, расширение прав и возможностей пациентов, персонализированная медицина и уход 2.0, а также социальная сфера — вот некоторые из главных вещей, которым вы должны уделять больше внимания.

Я изучал физиотерапию и управление бизнесом в сфере здравоохранения. Я также являюсь зарегистрированным внештатным сотрудником службы поддержки клиентов и брокером по временной помощи. У меня большой опыт работы на различных должностях в здравоохранении, социальной сфере, медицине и фармацевтической промышленности как на национальном, так и на международном уровне. Они обладают обширными медицинскими знаниями по большинству медицинских специальностей. и законы об уходе, которыми он регулируется и финансируется. Каждый год я посещаю большинство ведущих медицинских конференций в Европе и Америке, чтобы обновлять свои знания и быть в курсе последних разработок и инноваций. В настоящее время я получаю степень магистра в области прикладной психологии.

READ  Марсель Вербек в настоящее время является профессором трансляционных исследований нейродегенеративных расстройств.

Мои сообщения в этом блоге не отражают стратегию, политику или направление какого-либо владельца бизнеса, а также не спонсируются или не предназначены для выгоды какого-либо клиента или владельца бизнеса.